Verdächtigt wird unter anderem Beate Zschäpe. Sie weißt diesen Vorwurf allerdings von sich. Der Aussage zufolge hat aber ihr Freund Uwe Böhnhardt 2001 in einem iranischen Lebensmittelgeschäft einen Korb mit dem Sprengsatz deponiert. Bei der Explosion wurde die 19-jährige Tochter des Inhabers schwer verletzt. Vom Bau der Bombe habe Zschäpe nichts mitbekommen, heißt es in der Erklärung. Böhnhardt habe die Bombe gebaut, sein Komplize Mundlos vor dem Geschäft gewartet.

Drei Jahre später, im Juni 2004, wurden in der Kölner Keupstraße durch eine Nagelbombe mehr als 20 Menschen verletzt, einige lebensgefährlich. Bei einem dritten Anschlag in NRW wurde im April 2006 in Dortmund ein türkischstämmiger Kioskbetreiber erschossen. Böhnhardt und Mundlos hätten sie erst hinterher über Morde und Sprengstoffanschläge informiert. Als sie davon erfahren habe, sei sie sprachlos und fassungslos gewesen, erklärte Zschäpe.

In einer ersten Reaktion zeigte sich die Tochter des Dortmunder Opfers enttäuscht von Aussage und Prozessverlauf: "Schon wieder ein Schlag ins Gesicht", sagte Gamze Kubasik. Sie sei wütend und könne nicht nachvollziehen, dass die Angehörigen nicht die Chance bekämen, Fragen zu stellen. "Ich hätte mich wirklich gefreut", sagte sie und ergänzte: "Meistens haben wir nur Schläge ins Gesicht bekommen seit Beginn des Prozesses."

Zschäpe muss sich vor dem Oberlandesgericht München als Mittäterin an sämtlichen Verbrechen verantworten, die dem NSU angelastet werden, darunter zehn vorwiegend rassistisch motivierte Morde. Mundlos und Böhnhardt starben 2011 nach einem Banküberfall.